Цели и задачи дисциплины
Основной целью освоения дисциплины является: формирование основополагающих представлений о биоинформатики и ее возможностях; о приложении методов биоинформатики, в том числе, теоретического анализа и компьютерного моделирования, для решения фундаментальных и прикладных биомедицинских задач, что позволит в будущим молодым специалистам быстрее и эффективнее включиться в исследовательскую работу.
Задачами дисциплины являются: приобретение знаний в области биоинформатики, являющейся фундаментом для понимания функционирования биологических систем на молекулярном уровне, а именно, изучение основных подходов, методов и алгоритмов анализа биологических последовательностей; изучение основ анализа пространственных структур биополимеров.
Краткое содержание дисциплины
Предметом освоения дисциплины являются: основные положения и методология биоинформатики; языки программирования и основные алгоритмы, используемые для анализа биоинформационных данных; биоинформационные ресурсы.
Биоинформатика как предмет включает в себя три компонента:
1) создание баз данных для хранения больших наборов биологических данных и управления ими;
2) разработка алгоритмов и методов статистического анализа для определения отношений между элементами баз данных;
3) использование этих средств для анализа и интерпретации биологических данных различного типа (последовательностей ДНК, РНК, белков и белковых структур).
Биоинформатика реализуется в следующих видах деятельности:
1) управление биологическими данными, включая организацию, отслеживание, защиту, анализ и т.д.;
2) организация связи между учеными, проектами и учреждениями, вовлеченными в фундаментальные и прикладные биологические исследования;
3) организация наборов биологической информации, документов и литературы, а также обеспечение доступа к ним, их поиска и выборки;
4) анализ и интерпретация биологических данных с применением программных методов и алгоритмов.